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研究成果

李雪研究团队在International Journal of cancer上在线发表题为“Prediction of colorectal cancer risk based on profiling with common genetic variants”的研究论文

发布时间:2020-07-07 浏览次数:225


越来越多的研究确定了与结直肠癌相关的常见遗传变异,且基于常见遗传变异建立的多基因风险评分(PRS)可针对性的识别高风险人群。为了全面优化、测试遗传风险评分以预测结直肠癌的发生风险,我们的研究通过结合结直肠癌的遗传变异和潜在的结直肠癌风险因素及相关复杂性状建立风险分层预测模型,评估该遗传风险评分在一般人群中的分层效能。

本研究利用11项全基因组关联研究(GWASs)的荟萃分析结果(16871例结直肠癌病例和26328例对照),鉴定出了1,593个与结直肠癌显著相关的遗传变异位点(P<5×10−8)。将苏格兰结直肠癌病例对照研究(6,478例结直肠癌病例和11,043例对照)作为测试集,建立具有多个候选多基因风险评分的遗传预测模型;英国生物样本库(4800例结直肠癌病例和20287例对照)作为验证集,以评估该模型的最佳预测效能。

图1 UKBB中wPRS116的百分位数与位点特异性CRC风险之间的风险比和置信区间

结果显示,基于116个遗传变异位点建立的加权多基因风险评分(wPRS)具有最佳预测效能,该评分在苏格兰测试集中报告的C-统计量为0.60,且与结直肠癌风险显著相关(OR = 1.46,95%CI: 1.41-1.50,P = 1.71 × 10−116)。此wPRS的预测效能在英国生物样本库验证集中得到一致结果,C-统计量为0.61,并与结直肠癌风险呈显著相关性(OR=1.49,95% CI = 1.44-1.54,P = 6.67 × 10−128)。

目前,遗传风险评分(PRS)作为一种个性化的遗传评估,可以在任意年龄段检测,不易受时间、环境、生活行为习惯等因素干扰,已成为人群风险筛查的一种重要手段。在这项研究中,我们将遗传风险评分的预测效能与结直肠癌的多个区域遗传评分进行比较,表明遗传风险评分具有更广泛的应用潜力,这将为个体化精准筛查提供指导性建议。

原文链接:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/ijc.33191